O Departamento de Biologia ancora dois programas de Pós-Graduação:
O Programa de Pós-graduação em Biodiversidade - PPGBio, oficializado no final de 2020, é fruto de uma fusão dos Programas de Pós-graduação em Botânica (PPGB) e em Ecologia (PPGE), ambos do Departamento de Biologia, da Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE), em sua sede localizada em Recife, na área de Biodiversidade/CAPES. O PPGBio possui duas mobilidades de formação acadêmica (Mestrado e Doutorado), sendo representada por docentes lotados na UFRPE e em outras cinco instituições de Ensino e Pesquisa do Nordeste (dois da UFPE; um da UCSAL; um da UECG, um da UNEAL e um da UFAPE); todos com expressiva experiência em Ensino, Pesquisa e Extensão.
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O Programa de Pós-graduação em Etnobiologia e Conservação da Natureza - PPGEtno, propõe uma visão dialógica em conservação da natureza, considerando todas as dimensões envolvidas, sejam elas científicas, políticas e ideológicas. Incluir os seres humanos nessa discussão, como agentes transformadores da paisagem e dos recursos naturais, tornou-se algo tão óbvio, mas infelizmente negligenciado. Usualmente, o ser humano é colocado como algo que afeta os processos ecológicos, mas não como um elemento que faz parte e interage historicamente com os seres vivos e os diferentes ecossistemas. Nesse sentido, a etnobiologia surge como uma disciplina que, de fato, pode contribuir na formação de profissionais que possam encarar as relações seres humanos e natureza como objeto de investigação. Ao mesmo tempo, no programa de etnobiologia, um profissional voltado unicamente para as questões biológicas da conservação pode ter a sua sensibilidade desenvolvida ou despertada para enxergar a dimensão humana. Portanto, o programa se define em torno de dois grandes eixos, etnobiologia e conservação da natureza.
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